Desde sus inicios, en 1991, la Facultad de Medicina puso a la investigación como uno de los ejes de su quehacer. Es una actividad primordial de toda formación en la enseñanza universitaria, tanto de docentes como de estudiantes, es el corazón del conocimiento. Se busca que los alumnos investiguen y perfeccionen el conocimiento, pues la educación superior implica la búsqueda infatigable de la verdad y no la mera transmisión de saberes.

La Facultad cuenta, desde 2011, con un Centro de Investigación Biomédica (CIB), conformado por laboratorios que desarrollan ciencias básicas, y que potencian la investigación básica y la aplicada hacia la población. Está formado por el Laboratorio de Biología de la Reproducción, Inmunología Celular y Molecular, Neurociencias, Fisiología Integrativa y Molecular, Investigación e Ingeniería en Biopolímeros y Medicina Nanorregenerativa.